MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium kluyveri DSM 555 plasmid pCKL555A

Total Repeats: 1421

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009466	TTTA	2	8	51	58	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009466	CTT	2	6	90	95	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009466	ATA	2	6	101	106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009466	TAA	2	6	114	119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009466	TTA	2	6	139	144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009466	ATA	2	6	178	183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009466	ACTA	2	8	184	191	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009466	T	6	6	195	200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009466	A	6	6	201	206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009466	ACGT	2	8	245	252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009466	AT	3	6	254	259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009466	TTA	2	6	267	272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009466	TTA	2	6	275	280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009466	TA	4	8	283	290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009466	TA	4	8	293	300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009466	ATA	2	6	324	329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009466	TAA	2	6	337	342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009466	TAA	2	6	348	353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009466	TTA	2	6	371	376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009466	TCT	3	9	396	404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245108
21	NC_009466	AT	3	6	418	423	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
22	NC_009466	CTG	2	6	427	432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245108
23	NC_009466	TCC	2	6	440	445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245108
24	NC_009466	GGA	2	6	467	472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148245108
25	NC_009466	TAA	2	6	571	576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245108
26	NC_009466	T	6	6	598	603	0 %	100 %	0 %	0 %	148245108
27	NC_009466	TA	4	8	688	695	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
28	NC_009466	GCA	2	6	731	736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245108
29	NC_009466	TAT	2	6	747	752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245108
30	NC_009466	TAT	2	6	757	762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245108
31	NC_009466	T	6	6	783	788	0 %	100 %	0 %	0 %	148245108
32	NC_009466	CCA	2	6	843	848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148245108
33	NC_009466	CCA	2	6	873	878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148245108
34	NC_009466	ATT	2	6	886	891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245108
35	NC_009466	ATCA	2	8	1030	1037	50 %	25 %	0 %	25 %	148245108
36	NC_009466	TTTA	2	8	1051	1058	25 %	75 %	0 %	0 %	148245108
37	NC_009466	TAC	2	6	1071	1076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245108
38	NC_009466	T	7	7	1102	1108	0 %	100 %	0 %	0 %	148245108
39	NC_009466	TCT	2	6	1181	1186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245108
40	NC_009466	TAT	2	6	1224	1229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245108
41	NC_009466	T	7	7	1302	1308	0 %	100 %	0 %	0 %	148245108
42	NC_009466	TTC	2	6	1336	1341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245108
43	NC_009466	AAT	2	6	1353	1358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245108
44	NC_009466	TAAT	2	8	1395	1402	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
45	NC_009466	ATT	2	6	1460	1465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245108
46	NC_009466	CCT	2	6	1475	1480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245108
47	NC_009466	TAG	2	6	1498	1503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245108
48	NC_009466	TGA	2	6	1505	1510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245108
49	NC_009466	AATT	2	8	1512	1519	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
50	NC_009466	ATT	2	6	1549	1554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245108
51	NC_009466	CAAA	2	8	1602	1609	75 %	0 %	0 %	25 %	148245108
52	NC_009466	TTAT	2	8	1637	1644	25 %	75 %	0 %	0 %	148245108
53	NC_009466	TGT	2	6	1749	1754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245108
54	NC_009466	TAAA	2	8	1777	1784	75 %	25 %	0 %	0 %	148245108
55	NC_009466	ATTT	2	8	1809	1816	25 %	75 %	0 %	0 %	148245108
56	NC_009466	TCA	2	6	1833	1838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245108
57	NC_009466	ATC	2	6	1840	1845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245108
58	NC_009466	ATC	2	6	1924	1929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245108
59	NC_009466	TCC	2	6	1942	1947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245108
60	NC_009466	T	8	8	2044	2051	0 %	100 %	0 %	0 %	148245108
61	NC_009466	T	7	7	2070	2076	0 %	100 %	0 %	0 %	148245108
62	NC_009466	TA	3	6	2088	2093	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
63	NC_009466	CTG	2	6	2107	2112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245108
64	NC_009466	ATTT	2	8	2121	2128	25 %	75 %	0 %	0 %	148245108
65	NC_009466	T	6	6	2126	2131	0 %	100 %	0 %	0 %	148245108
66	NC_009466	ATC	2	6	2164	2169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245108
67	NC_009466	CCAG	2	8	2187	2194	25 %	0 %	25 %	50 %	148245108
68	NC_009466	TAA	2	6	2241	2246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245108
69	NC_009466	CAC	2	6	2322	2327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148245108
70	NC_009466	TGG	2	6	2382	2387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245108
71	NC_009466	CTG	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245108
72	NC_009466	GTT	2	6	2413	2418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245108
73	NC_009466	CTTT	2	8	2478	2485	0 %	75 %	0 %	25 %	148245108
74	NC_009466	CTTTT	2	10	2517	2526	0 %	80 %	0 %	20 %	148245108
75	NC_009466	T	6	6	2536	2541	0 %	100 %	0 %	0 %	148245108
76	NC_009466	TAA	2	6	2555	2560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245108
77	NC_009466	T	8	8	2567	2574	0 %	100 %	0 %	0 %	148245108
78	NC_009466	AT	3	6	2605	2610	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
79	NC_009466	AT	3	6	2690	2695	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
80	NC_009466	T	6	6	2730	2735	0 %	100 %	0 %	0 %	148245108
81	NC_009466	TA	3	6	2767	2772	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
82	NC_009466	TTATTG	2	12	2849	2860	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148245108
83	NC_009466	AAG	2	6	2880	2885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148245108
84	NC_009466	TGGA	2	8	2896	2903	25 %	25 %	50 %	0 %	148245108
85	NC_009466	ATTTT	3	15	2910	2924	20 %	80 %	0 %	0 %	148245108
86	NC_009466	GCC	2	6	3026	3031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245109
87	NC_009466	TAA	2	6	3074	3079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245109
88	NC_009466	ATC	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245109
89	NC_009466	CT	3	6	3319	3324	0 %	50 %	0 %	50 %	148245109
90	NC_009466	T	6	6	3324	3329	0 %	100 %	0 %	0 %	148245109
91	NC_009466	TCA	2	6	3350	3355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245109
92	NC_009466	T	6	6	3362	3367	0 %	100 %	0 %	0 %	148245109
93	NC_009466	TAA	2	6	3426	3431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245109
94	NC_009466	TCA	2	6	3449	3454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245109
95	NC_009466	TCT	2	6	3459	3464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245109
96	NC_009466	T	7	7	3477	3483	0 %	100 %	0 %	0 %	148245109
97	NC_009466	CT	3	6	3520	3525	0 %	50 %	0 %	50 %	148245109
98	NC_009466	ATC	2	6	3637	3642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245110
99	NC_009466	T	6	6	3722	3727	0 %	100 %	0 %	0 %	148245110
100	NC_009466	AT	3	6	3735	3740	50 %	50 %	0 %	0 %	148245110
101	NC_009466	ACTG	2	8	3784	3791	25 %	25 %	25 %	25 %	148245110
102	NC_009466	CAT	2	6	3795	3800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245110
103	NC_009466	ATACC	2	10	3831	3840	40 %	20 %	0 %	40 %	148245110
104	NC_009466	TTA	2	6	3855	3860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245110
105	NC_009466	TTA	2	6	3869	3874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245110
106	NC_009466	ATTC	2	8	3921	3928	25 %	50 %	0 %	25 %	148245110
107	NC_009466	ATTTTA	2	12	3971	3982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245110
108	NC_009466	TCA	2	6	3986	3991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245110
109	NC_009466	CAC	2	6	4006	4011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_009466	CTT	2	6	4037	4042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245111
111	NC_009466	TA	3	6	4056	4061	50 %	50 %	0 %	0 %	148245111
112	NC_009466	T	7	7	4075	4081	0 %	100 %	0 %	0 %	148245111
113	NC_009466	AAG	2	6	4156	4161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148245111
114	NC_009466	TTTA	2	8	4168	4175	25 %	75 %	0 %	0 %	148245111
115	NC_009466	TTCT	2	8	4183	4190	0 %	75 %	0 %	25 %	148245111
116	NC_009466	TA	3	6	4207	4212	50 %	50 %	0 %	0 %	148245111
117	NC_009466	TCT	2	6	4244	4249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245111
118	NC_009466	TAA	2	6	4252	4257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245111
119	NC_009466	ATTT	2	8	4258	4265	25 %	75 %	0 %	0 %	148245111
120	NC_009466	CAG	2	6	4270	4275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245111
121	NC_009466	T	6	6	4299	4304	0 %	100 %	0 %	0 %	148245111
122	NC_009466	TAA	2	6	4335	4340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245111
123	NC_009466	TCA	2	6	4349	4354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245111
124	NC_009466	AT	3	6	4371	4376	50 %	50 %	0 %	0 %	148245111
125	NC_009466	TA	3	6	4384	4389	50 %	50 %	0 %	0 %	148245111
126	NC_009466	TCC	2	6	4411	4416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245111
127	NC_009466	TTAT	2	8	4457	4464	25 %	75 %	0 %	0 %	148245111
128	NC_009466	ATT	2	6	4483	4488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245111
129	NC_009466	CCT	2	6	4612	4617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245112
130	NC_009466	TC	3	6	4638	4643	0 %	50 %	0 %	50 %	148245112
131	NC_009466	TTGC	2	8	4672	4679	0 %	50 %	25 %	25 %	148245112
132	NC_009466	ATTT	2	8	4696	4703	25 %	75 %	0 %	0 %	148245112
133	NC_009466	CAT	2	6	4705	4710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245112
134	NC_009466	ATC	2	6	4718	4723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245112
135	NC_009466	TA	3	6	4778	4783	50 %	50 %	0 %	0 %	148245112
136	NC_009466	ATC	2	6	4796	4801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245112
137	NC_009466	T	6	6	4808	4813	0 %	100 %	0 %	0 %	148245112
138	NC_009466	T	6	6	4819	4824	0 %	100 %	0 %	0 %	148245112
139	NC_009466	CTC	2	6	4861	4866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_009466	CTA	2	6	5025	5030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_009466	AT	3	6	5094	5099	50 %	50 %	0 %	0 %	148245113
142	NC_009466	TCC	2	6	5146	5151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245113
143	NC_009466	GCACT	2	10	5162	5171	20 %	20 %	20 %	40 %	148245113
144	NC_009466	AC	3	6	5188	5193	50 %	0 %	0 %	50 %	148245113
145	NC_009466	AAAT	2	8	5216	5223	75 %	25 %	0 %	0 %	148245113
146	NC_009466	TAA	2	6	5265	5270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245113
147	NC_009466	CTT	2	6	5297	5302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245113
148	NC_009466	TAT	2	6	5313	5318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245113
149	NC_009466	T	6	6	5332	5337	0 %	100 %	0 %	0 %	148245113
150	NC_009466	CTT	2	6	5365	5370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245113
151	NC_009466	AT	3	6	5385	5390	50 %	50 %	0 %	0 %	148245113
152	NC_009466	TGC	2	6	5403	5408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245113
153	NC_009466	AT	3	6	5411	5416	50 %	50 %	0 %	0 %	148245113
154	NC_009466	CT	3	6	5434	5439	0 %	50 %	0 %	50 %	148245113
155	NC_009466	CTT	2	6	5549	5554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_009466	TAA	2	6	5568	5573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_009466	TTA	2	6	5595	5600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_009466	TAAT	2	8	5610	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_009466	TTA	2	6	5701	5706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_009466	TC	3	6	5815	5820	0 %	50 %	0 %	50 %	148245114
161	NC_009466	TTTG	2	8	5828	5835	0 %	75 %	25 %	0 %	148245114
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163	NC_009466	ACCT	2	8	5928	5935	25 %	25 %	0 %	50 %	148245114
164	NC_009466	CTT	2	6	5963	5968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245114
165	NC_009466	T	6	6	5967	5972	0 %	100 %	0 %	0 %	148245114
166	NC_009466	AAT	2	6	6021	6026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_009466	CAA	2	6	6093	6098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_009466	CATTAC	2	12	6114	6125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_009466	CAA	2	6	6138	6143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_009466	T	8	8	6148	6155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_009466	TAA	2	6	6179	6184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_009466	ACC	2	6	6196	6201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
173	NC_009466	TCATTT	2	12	6208	6219	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
174	NC_009466	ATTCT	2	10	6235	6244	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
175	NC_009466	TCT	2	6	6261	6266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_009466	AC	3	6	6300	6305	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
177	NC_009466	CCT	2	6	6325	6330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
178	NC_009466	CATTTC	2	12	6380	6391	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148245115
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180	NC_009466	TTA	4	12	6501	6512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245115
181	NC_009466	CCT	2	6	6528	6533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245115
182	NC_009466	TCC	2	6	6555	6560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245115
183	NC_009466	CAT	2	6	6655	6660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245115
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188	NC_009466	TA	3	6	6800	6805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_009466	TTCT	2	8	6878	6885	0 %	75 %	0 %	25 %	148245116
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196	NC_009466	TCCT	2	8	7105	7112	0 %	50 %	0 %	50 %	148245116
197	NC_009466	T	7	7	7119	7125	0 %	100 %	0 %	0 %	148245116
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200	NC_009466	CTA	2	6	7381	7386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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202	NC_009466	ATTT	2	8	7424	7431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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204	NC_009466	TAA	2	6	7451	7456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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245	NC_009466	AAT	2	6	9328	9333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245123
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253	NC_009466	TCC	2	6	9721	9726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245123
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271	NC_009466	ATT	2	6	10576	10581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245123
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273	NC_009466	TTTTC	2	10	10656	10665	0 %	80 %	0 %	20 %	148245123
274	NC_009466	TTC	2	6	10723	10728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245123
275	NC_009466	T	7	7	10729	10735	0 %	100 %	0 %	0 %	148245123
276	NC_009466	TCT	2	6	10766	10771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245123
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278	NC_009466	CTT	2	6	10791	10796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245123
279	NC_009466	ATTTTT	2	12	10807	10818	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148245123
280	NC_009466	CAT	2	6	10848	10853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245123
281	NC_009466	T	7	7	10863	10869	0 %	100 %	0 %	0 %	148245123
282	NC_009466	AT	3	6	10881	10886	50 %	50 %	0 %	0 %	148245123
283	NC_009466	T	6	6	10932	10937	0 %	100 %	0 %	0 %	148245123
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286	NC_009466	TATCT	2	10	11098	11107	20 %	60 %	0 %	20 %	148245123
287	NC_009466	AT	3	6	11133	11138	50 %	50 %	0 %	0 %	148245123
288	NC_009466	TTC	2	6	11155	11160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245123
289	NC_009466	CTTT	2	8	11172	11179	0 %	75 %	0 %	25 %	148245123
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292	NC_009466	TTC	2	6	11252	11257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245123
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300	NC_009466	TTA	2	6	11604	11609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245123
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399	NC_009466	ATTTA	2	10	16346	16355	40 %	60 %	0 %	0 %	148245132
400	NC_009466	TCC	2	6	16399	16404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245133
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406	NC_009466	AAGC	2	8	16712	16719	50 %	0 %	25 %	25 %	148245134
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